Из постановления ВАС РФ № 67 от 20.12.06 следует, что ликвидация общества и его исключение из ЕГРЮЛ — это не одно и то же. Значит, для Вашего случая статья 63 ГК не подходит, так как процедура ликвидации ЗАО не выполнена, хотя общество в ЕГРЮЛ больше не числится. Однако в судебной практике эту статью применяют по аналогии, например, так поступил ФАС Московского округа, который при рассмотрении дела № А40−20224/12−133−187 признал право учредителя на деньги в банке, ранее принадлежавшие ООО, исключенному из ЕГРЮЛ.

Придерживаясь аналогий, можно применить пункт 1 статьи 67 ГК для того, чтобы единственный участник ЗАО получил часть имущества материнской компании, в том числе деньги на расчетном счете и долю в уставном капитале. Таким способом сразу перевести долю в дочернее общество нельзя, надо обязательно сделать так, чтобы имущество сначала перешло физическому лицу. С очень высокой вероятностью банк и налоговая инспекция откажутся переводить собственность ЗАО на физическое лицо, и тогда придется составлять иск в суд.

Как вариант, можно опираться на пункты 8 и 16 статьи 21 Закона № 14-ФЗ, и тогда доля ЗАО перейдет прямо во владение ООО. В этой статье речь идет о том, что при ликвидации юридического лица, принадлежавшая ему доля может быть передана кому-нибудь только с согласия других участников общества. Если согласия нет, доля автоматически переходит в распоряжение самого ООО. Конечно, в Вашем случае юридическое лицо не было ликвидировано, его просто исключили из ЕГРЮЛ и признали несуществующим. Но напомню, что закон разрешается применять по аналогии. Обратите внимание, что если доля ЗАО перейдет к обществу, то общество обязано выплатить участникам бывшей материнской компании стоимость этой доли в срок, предусмотренный законом.