В Вашем случае получить компенсацию за задержку при доставке груза можно только в судебном порядке. Факт просрочки налицо и не может быть оспорен. В статье 401 Гражданского кодекса указано, что лицо, выполнившее обязательства не должным образом при наличии вины несет ответственность за несоблюдение условий договора. Однако вина снимается, если участник соглашения сделал все возможное, чтобы соблюсти договоренности, но его усилия по объективным обстоятельствам не привели к желаемому результату. Скорее всего, именно на этом будет настаивать Ваш оппонент, защищаясь от обвинений, поскольку срок оформления документов таможенными органами никак не зависит от прихотей перевозчика. Кроме того, договор нужно было составлять с учетом сроков таможенной проверки.

Постарайтесь уладить проблему в досудебном порядке. Направьте перевозчику мотивированную претензию. Если в течение 30 дней с момента получения претензии компанией Ваши требования не будут удовлетворены или будут удовлетворены только отчасти, обращайтесь с иском в суд. Без письменной претензии суд в соответствии со статьей 797 Гражданского кодекса откажется рассматривать Ваш иск.